WCS是控制自动化仓库物流设备的“四肢”，设备层通过传感器、电机、各类开关等信号传输给WCS。

WCS对每种设备的控制大致归纳为两个层次：设备控制层、设备通讯层。

设备控制层发出特殊设备控制指令，到具体的物流设备中，物流设备的状态则从反方向传到上层。设备通讯层则只负责不同设备的链接。

需要明确的是，WCS通常并不直接控制物流设备的动作，而只是协调多种设备的工作。因为每一个设备都有自身的控制系统，在自动化系统中最常见的就是PLC（可编程逻辑控制器），WCS只需要和PLC中的控制程序通讯即可。

除了信息流程控制以外，WCS还对实物搬运流程进行控制。WCS基于最优搜索路径算法，结合自动化仓库中物流设备的特点，建立路径管理。并且根据关键设备的状态，调整控制策略，平衡不同设备间的工作负荷。

自动化仓库的规划中，首先要解决物流系统的整体流程规划、功能规划等问题，以及为了满足流程或完成功能所需要配置的相应硬件设备的选择问题；其次要解决物流软件的规划问题，包括WMS和WCS。

WMS通过出入库业务、仓库调拨等功能，有效控制并跟踪仓库业务的物流和成本管理全过程，实现或完善企业的仓储信息管理。

WCS是介于WMS系统和PLC系统之间的一层管理控制系统，是WMS和物流设备之间的桥梁，负责协调底层的各种物流设备。使底层物流设备可以执行仓储系统的业务流程，并且进行最优路径调度。

在订单处理过程中，WMS通过订单管理系统（OMSERP)下载一个订单执行和交付任务给WCS系统，WCS系统通过库存管理算法，定位库存位置，根据商品属性选择移动容器拣选商品，WMS管理整个仓库的库存和实时跟踪库存数量。